Jayakarta (Surabaya Gubeng–Pasar Senen)
Joglosemarkerto (Yogyakarta–Cilacap–Semarang–Solo–Purwokerto)
Kaligung (Semarang Poncol–Tegal/Cirebon/Brebes)
Kamandaka (Semarang Tawang–Cilacap via Tegal dan Purwokerto)
Lodaya (Bandung–Solo)
Logawa (Ketapang–Purwokerto)
Madiun Jaya (Madiun–Pasar Senen)
Majapahit (Malang–Pasar Senen)
Malabar (Malang–Bandung)
Malioboro Ekspres (Malang–Purwokerto)
Mataram (Solo Balapan–Pasar Senen)
Matarmaja (Malang–Pasar Senen)
Menoreh (Semarang Tawang–Pasar Senen)
Mutiara Selatan (Surabaya Gubeng–Bandung)
Mutiara Timur (Surabaya Pasarturi–Ketapang)